编者按:基于细胞游离DNA(cfDNA)的液体活检被认为是极具前景的早期肝细胞癌(HCC)诊断方法。但由于一次抽血中获得的cfDNA产量有限,单次只能进行单个组学层面(如突变,甲基化等)的检测,限制了大多数样本的使用。中医院细胞及分子生物研究室焦宇辰课题组、外科赵宏教授团队和免疫学研究室曲春枫课题组合作研发了“突变胶囊Plus(MCP)”技术,该技术可对一份cfDNA样本进行多重分析,包括同时检测突变和甲基化改变,以及在全基因组范围内发现新的甲基化标志物。研究表明,MCP技术具有发现和验证多组学生物标志物的潜力,适用于癌症的无创活检。《肿瘤瞭望》特此报道,以飨读者。
DOI:10./scitranslmed.abp
该研究成果于近日以ResearchArticle形式发表于ScienceTranslationalMedicine杂志(IF=19)。国家分子肿瘤学重点实验室焦宇辰、曲春枫研究员和中医院肝胆外科赵宏教授为论文的共同通讯作者。
研究背景
晚期HCC的5年生存率仅为12%,通过早期发现从而及时手术切除是治疗HCC最有效的方法。当前,临床亟需一种能高精度地检测可切除的HCC的方法。基于cfDNA的液体活检技术就是一种可应用于临床的极具前景的无创诊断方法。此前研究已经确定了潜在的癌症诊断标志物,如体细胞突变、甲基化改变、cfDNA片段大小分布和cfDNA断点信息等。
在HCC的相关研究中,多项研究证实了通过检测cfDNA突变识别肝癌的有效性。然而,由于采样问题,检测含量较低的cfDNA的低频突变是困难的。DNA甲基化改变是癌症进展过程中最早发生的分子变化之一,异常的DNA甲基化改变,包括CpG岛(CGIs)的高甲基化,可能是包括HCC在内的几乎所有人类肿瘤类型的标志物。cfDNA甲基化检测可用于癌症的诊断、预后和监测。亚硫酸氢盐测序被认为是DNA甲基化分析的“金标准”;然而,该方法会造成大量的DNA损伤,降低cfDNA的可检测性进而影响检测灵敏度。
根据先前的研究,多组学生物标志物的组合分析,如甲基化、突变和蛋白标志物,可能提高癌症检测的性能。然而,大多数cfDNA检测技术单次只能检测一种类型的生物标志物,而一次抽血所含的cfDNA产量通常不足以支持多次检测。因此,既往大多数研究都只